Да, здесь надо прямо-таки обновлять. Нельзя просто взять и сказать update — тебя не поймут. У postgres’а целое приложение консольное есть, чтобы правильно обновиться.

Итак:

1. Стопорим postgres. У всех по-разному, например service postgres stop;
2. Выполняем команду:

   
initdb /usr/local/var/postgres_version -E utf8

   postgres_version меняем на что-то более вменяемое, типа postgres9.6.1. C параметром -E всё понятно – кодировка темплейта (кто знает, что такое темплейт, – добро пожаловать в комментарии). Все базы будут иметь эту кодировку по умолчанию при создании;
3. Дальше запускаем следующую красоту:

   pg_upgrade -v \
        -d /usr/local/var/postgres \
        -D /usr/local/var/postgres_version \
        -b /usr/local/Cellar/postgresql/9.5.4/bin/ \
        -B /usr/local/Cellar/postgresql/9.6.1/bin/

   Здесь -d — старая директория данных, -D – новая директория, которую мы указали в шаге 2, -b — старая директория, где стоит postgres, -B — директория новой версии postgres;
4. Меняем местами старую и новую базы:

   cd /usr/local/var
   mv postgres postgres9.5.4
   mv postgres9.6.1 postgres

   Если при установке вы решили блеснуть мастерством и поменяли пути, то тут надо подставлять ваши директории;
5. Рестартуем postgres и получаем удовольствие. Но если не повезло, то идём читать логи, stackoverflow и хабр.

Немного линков: initdb, pg_upgrade.